在Mybatis中配置多数据源有两种常用的方法：

1. 使用Mybatis提供的多数据源插件 可以通过配置mybatis的拦截器来实现多数据源的切换，Mybatis提供了一个多数据源插件MultiDataSourcePlugin，可以通过以下方式进行配置：

@Bean
public MultiDataSourcePlugin multiDataSourcePlugin() {
    MultiDataSourcePlugin multiDataSourcePlugin = new MultiDataSourcePlugin();
    // 配置数据源名和对应的SqlSessionFactory
    multiDataSourcePlugin.addDataSource("dataSource1", dataSource1);
    multiDataSourcePlugin.addDataSource("dataSource2", dataSource2);
    return multiDataSourcePlugin;
}

@Bean
public SqlSessionFactory sqlSessionFactory() throws Exception {
    SqlSessionFactoryBean sqlSessionFactoryBean = new SqlSessionFactoryBean();
    sqlSessionFactoryBean.setDataSource(multiDataSourcePlugin().getDataSource());
    return sqlSessionFactoryBean.getObject();
}

2. 使用Spring的@Configuration注解 使用Spring的@Configuration注解实现多数据源的配置，可以通过@Bean注解来分别配置不同的数据源和SqlSessionFactory，然后通过@Qualifier注解指定要使用的数据源，示例如下：

@Configuration
public class MybatisConfig {

    @Primary
    @Bean
    @ConfigurationProperties(prefix = "spring.datasource.dataSource1")
    public DataSource dataSource1() {
        return DataSourceBuilder.create().build();
    }

    @Bean
    @ConfigurationProperties(prefix = "spring.datasource.dataSource2")
    public DataSource dataSource2() {
        return DataSourceBuilder.create().build();
    }

    @Primary
    @Bean
    public SqlSessionFactory sqlSessionFactory1(@Qualifier("dataSource1") DataSource dataSource1) throws Exception {
        SqlSessionFactoryBean sqlSessionFactoryBean = new SqlSessionFactoryBean();
        sqlSessionFactoryBean.setDataSource(dataSource1);
        return sqlSessionFactoryBean.getObject();
    }

    @Bean
    public SqlSessionFactory sqlSessionFactory2(@Qualifier("dataSource2") DataSource dataSource2) throws Exception {
        SqlSessionFactoryBean sqlSessionFactoryBean = new SqlSessionFactoryBean();
        sqlSessionFactoryBean.setDataSource(dataSource2);
        return sqlSessionFactoryBean.getObject();
    }
}

以上是两种常用的多数据源配置方法，根据具体的需求和项目情况选择合适的方式进行配置。