在Photoscan中合并堆栈的方法如下：

1. 打开Photoscan软件，并导入需要合并的堆栈照片。
2. 在菜单栏中选择“工作流程” -> “对齐照片”来对照片进行对齐。
3. 在对齐完成后，选择“工作流程” -> “建立模型”来建立3D模型。
4. 在建模完成后，选择“工作流程” -> “建立纹理”来为模型添加纹理。
5. 最后，在菜单栏中选择“工作流程” -> “导出模型”来导出合并后的堆栈照片。

通过上述步骤，您可以将堆栈照片合并为一个完整的3D模型并进行导出。