配置JPA多数据源的步骤如下：

1. 在application.properties或application.yml文件中配置多个数据源的连接信息，包括数据库的URL、用户名、密码等。

2. 创建多个DataSource bean，分别代表不同的数据源，并分别指定对应的连接信息。

3. 创建多个EntityManagerFactory bean，分别使用不同的数据源和JpaVendorAdapter来创建EntityManager。

4. 创建多个TransactionManager bean，分别使用对应的EntityManagerFactory来管理事务。

5. 在需要使用的Repository接口中使用@Qualifier注解指定要使用的数据源对应的EntityManager。

6. 在使用时，根据需要使用的数据源注入对应的Repository接口，并通过该Repository接口操作对应的数据源。

通过以上步骤配置JPA多数据源后，就可以在一个应用中同时操作多个数据库了。