要定制Flowchart.js连接路径的箭头样式，可以使用Flowchart.js提供的option参数进行设置。以下是一个例子：

var chart = new FlowChart({
  arrowEnd: "block",
  arrowEndColor: "#ff0000",
  arrowEndSize: 10
});

在上面的例子中，我们使用了arrowEnd、arrowEndColor和arrowEndSize这三个option参数来定制连接路径的箭头样式。arrowEnd指定了箭头的形状，可以是"block"、“classic”、“diamond"或者"open”；arrowEndColor指定了箭头的颜色；arrowEndSize指定了箭头的大小。

通过设置这些option参数，您可以定制连接路径的箭头样式，使得Flowchart.js生成的图表更符合您的需求。